El Dr. Perry ha pertenecido a las juntas directivas de instituciones como Global Development Network, la Asociación Latinoamericana de Economistas, Fedesarrollo, la Universidad de los Andes, el Banco de Bogotá, la Caja Social de Ahorros, la Corporación de Ahorro Vivienda Colmena, Fogafín, Ecopetrol, la Fundación Natura, y la Fundación Teatro Libre de Bogotá, entre otras.
Se ha desempeñado como Ministro de Hacienda de Colombia, Ministro de Minas y Energía, Director Nacional de Impuestos, Director de Fedesarrollo, Director del Centro de Estudios sobre Desarrollo Económico CEDE de la Universidad de los Andes, Subdirector del Departamento Nacional de Planeación, y como Gerente de la firma de consultoría Mejía, Millán y Perry Ltda.
Guillermo Perry cuenta con un título en Ingeniería de la Universidad de los Andes y realizó estudios de Ph.D en Economía e Investigación de Operaciones en MIT. Ha publicado numerosos artículos en temas de macroeconomía, finanzas internacionales, política fiscal, financiera y energética.